แนวทางใหม่ที่รวดเร็วทันใจแล้วก็มีประสิทธิภาพสำหรับการสร้างโปรไฟล์ของเซลล์โดดเดี่ยว

หลายเซลล์ในร่างกายของเราทำงานในลักษณะปกปิดวิทยาศาสตร์ที่ยังไม่เข้าใจ ที่ยังไปสำหรับเซลล์ภูมิต้านทานที่มีความจำเป็นสำหรับการป้องกันพวกเราจากโรครุนแรง

เพื่อที่จะเอาชนะปัญหานี้นักค้นคว้ามานะเป็นอย่างมากสำหรับเพื่อการหาวิธีใหม่ในการศึกษาเรียนรู้ผลงานภายในของเซลล์แต่ละเซลล์

ความท้าเป็นไม่เพียงแต่ แม้กระนั้นจะแยกเซลล์ออกมาจากตัวอย่างเยื่อนอกนั้นเรายังจำเป็นที่จะต้องหาวิธีการสำรวจการทำงานของเซลล์แต่ละเซลล์ด้วย” ดร. เคดาร์ที่นาธานท้องนาน้ำผู้ช่วยศาสตราจารย์และก็หัวหน้างานศึกษาค้นคว้าภาควิชาชีวเคมีรวมทั้งชีววิทยาระดับโมเลกุลกล่าว มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นเดนมาร์ก

ในการศึกษาวิจัยใหม่นำโดย Kedar Nath Natarajan รวมทั้ง Xi Chen จากสถาบัน Wellcome Sanger Institute ทีมนักวิจัยได้ปรับปรุงกรรมวิธีการใหม่สำหรับเพื่อการทำเป็นชิ้นเล็กชิ้นเล็กข้างในอวัยวะและเยื่อของกล้องจุลทรรศน์

กรรมวิธีการใหม่ช่วยให้พวกเขาสามารถวิเคราะห์เซลล์ได้มากกว่า 3000 เซลล์จากม้ามซึ่งเป็นจุดที่มีฮอตปอสำหรับเซลล์ภูมิคุ้มกันทุกชนิด เซลล์ที่ต่อสู้กับการติดเชื้อ แต่ยังส่งผลให้ภูมิคุ้มกันในชีวิตประจำวันแล้วก็การโต้ตอบ

กระบวนการใหม่ๆได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องเพื่อแสดงเนื้อหาของเซลล์คนเดียวด้านในอวัยวะและเยื่อ วิธีการคือการเรียนแบบเบื้องต้นของสิ่งมีชีวิตอาทิเช่น DNA รวมทั้งกระบวนการใส่ด้านในเซลล์เดียว บรรจุภัณฑ์นี้เรียกว่า chromatin และสัญญาณที่ยีนด้านในพิมพ์เขียวถูกเปิดแล้วก็ปิดด้วยเหตุนี้ก็เลยพิจารณาว่าจะเปลี่ยนเป็นเซลล์เม็ดเลือดเซลล์ผิวหนังเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์มะเร็งหรือเซลล์ชนิดอื่น

กรรมวิธีใหม่ของเราสำหรับในการทำให้โครเมียมภายในเซลล์เดียวมีทางเลือกที่มีประสิทธิภาพสามารถปรับขนาดได้แล้วก็ถูกกว่าสำหรับวิธีการที่นำสมัยที่สุดซึ่งจำเป็นที่จะต้องมีองค์ประกอบเบื้องต้นที่แพงแพงวัสดุอุปกรณ์พิเศษและอุปกรณ์ต่างๆ” นายติดอยู่เดรนาธัตนานันกล่า

ร่วมกับคนเขียน Xi Chen คนแรกจากสถาบัน Wellcome Sanger Institute เขาเป็นผู้นำในการพัฒนาขั้นตอนการใหม่ๆและสร้างเนื้อหาเกี่ยวกับเซลล์ต่างๆดังเช่นเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์ต้นกำเนิดฯลฯผู้ร่วมวิจัยจากสถาบัน Wellcome Sanger ดังเช่นว่า Ricardo J Miragaia แล้วก็งานนี้ได้รับการดำเนินการในห้องทดลองของคนเขียน Sarah A Teichmann ที่เกี่ยวข้อง

บทคัดย่อของกระดาษให้คำอธิบายนี้:

การตรวจหาลำดับเบสของ transposase-chromatography (ATAC-seq) ใช้กันอย่างมากมายเพื่อระบุขอบเขตของกฎที่ต้องปฏิบัติตามทั่วอีกทั้งจีโนม แต่การเล่าเรียนปริมาณน้อยได้รับการดำเนินงานในระดับเซลล์ลำพัง(scATAC-seq) เนื่องมาจากความท้าทายทางเทคนิค ที่นี่พวกเราได้ปรับปรุงวิธีการ scATACseq ที่เรียบง่ายและมีประสิทธิภาพโดยใช้การรวมแท็ก Tn5 ที่มีการเรียงsingle-nuclei เราแสดงให้เห็นว่าขั้นตอนการของพวกเราสามารถดำเนินการได้อย่างราบรื่นในระบบต่างๆและเซลล์ที่สดรวมทั้งเก็บรักษาได้จากเนื้อเยื่อหลัก โดยการทำโปรไฟล์มากยิ่งกว่า 3,000 splenocytes พวกเราจะเจาะจงประเภทของเซลล์ภูมิคุ้มกันที่แตกต่างกันออกไปแล้วก็แสดงขอบเขตการกำกับดูแลเฉพาะที่เกี่ยวพันกับเซลล์และต้นเหตุการถอดรหัสที่เกี่ยวเนื่อง